超过保质期限的食品应处理的方法是由有关主管部门没收违法所得、违法生产经营的食品或者是处罚款，如果情节严重的，吊销许可证。销售不合格食品罪立案标准是只要行为人实施了犯罪行为的，即需要承担刑事责任。
一、
超过保质期限的食品应如何处理
超过保质期限的食品应如下处理：
根据《食品安全法》第八十五条，经营超过保质期的食品的，由有关主管部门按照各自职责分工，没收违法所得、违法生产经营的食品和用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品；违法生产经营的食品货值金额不足一万元的，并处二千元以上五万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额五倍以上十倍以下罚款；情节严重的，吊销许可证。
二、
食品保质期是怎么定的
食品保质期是根据对食品进行微生物试验、理化试验及感官检查等客观的质量变化分析确定，由生产者在现实使用的食品上提供标注，保质期内的食品应当完全适于出售和食用。
《中华人民共和国食品安全法》第五十四条，食品经营者应当按照保证食品安全的要求贮存食品，定期检查库存食品，及时清理变质或者超过保质期的食品。食品经营者贮存散装食品，应当在贮存位置标明食品的名称、生产日期或者生产批号、保质期、生产者名称及联系方式等内容。
三、
食品安全事故等级怎么划分
预案将食品安全事故划分为四级，即特别重大食品安全事故、重大食品安全事故、较大食品安全事故和一般食品安全事故。找法网提醒您，食品安全事故发生后，按照预案的规定，卫生行政部门应依法组织对事故进行分析评估，核定事故级别。
其中，特别重大食品安全事故，由卫生部会同食品安全办向国务院提出启动I级响应的建议，经国务院批准后，成立国家特别重大食品安全事故应急处置指挥部，统一领导和指挥事故应急处置工作。此外，重大、较大、一般食品安全事故，分别由事故所在地省、市、县级人民政府组织成立相应应急处置指挥机构，统一组织开展本行政区域事故应急处置工作。